BUCEO DE SUPERFICIE Y PROFUNDIDAD: En ciertos sectores de la Reserva Marina de Galápagos, es posible realizar buceo de superficie y profundidad y tener contacto con las impresionantes especies acuáticas que viven bajo la superficie del mar: arrecifes de coral, ballenas, tiburones ballena, tiburones martillo, rayas, mantarrayas, peces espada, tortugas… Por el fondo del Océano se desplazan fuertes corrientes marinas y protuberancias de lava que los deportistas deben tomar en cuenta mientras miran los maravillosos habitantes del agua. Otros hábitats marinos son los fondos rocosos, las paredes verticales de roca y los manglares. De igual forma, hay fenómenos naturales que afectan el área como los afloramientos de aguas frías y el Fenómeno de El Niño.
BAHIA ACADEMIA Esta es la bahía de Puerto Ayora, donde hay 4 sitios de buceo. Dos de estos sitios son muy tranquilos y con poca corriente, por lo cual son ideales para principiantes o estudiantes de buceo. Los otros dos sitios son recomendados para buzos intermedios y expertos porque a veces hay corrientes y resacas. Se pueden apreciar: varias especies de peces de arrecife, rayas sartén, rayas águila, rayas doradas, morenas, anguilas de jardín, lobos marinos, iguanas marinas, tortugas marinas, tiburones de aleta blanca e invertebrados.
BEAGLE
Esta compuesta por tres rocas expuestas ubicadas al sur de la isla Santiago. En condiciones normales no presenta corrientes fuertes. El buceo se realiza en todo el entorno sur de la isla más grande donde hay una plataforma a los 12 metros que llega hasta una pared submarina cubierta de corales, esta pared llega a más de 60 metros. Entre las especies de mega fauna que se pueden observar encontramos manta raya: tiburón martillo, tiburón de galápagos, rayas pequeñas, tintoreras, tortugas, lobos marinos, barracudas, muchos peces de arrecifes.
ROCA GORDON (experiencia mínima 30 buceos registrados)
Esta formación rocosa es un sitio de buceo de fama mundial. Es para buzos intermedios y expertos porque pueden presentarse de pronto corrientes y oleajes fuertes. Los sitios de buceo en Rocas Gordon son principalmente paredes con fondo profundo. Se pueden ver peces de arrecife, grandes peces pelágicos, rayas doradas, sartén y águila, tortugas marinas, colonia de lobos marinos, focas peleteras endémicas, morenas, invertebrados, tiburones de aleta blanca y de galápagos. La principal atracción son los tiburones martillo que con frecuencia aparecen en grandes cardúmenes.
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